Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNRC6CQ9HCJ0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms