Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms