Protein–RNA interactions for Protein: Q9H649

NSUN3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN3Q9H649 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSUN3Q9H649 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSUN3Q9H649 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NSUN3Q9H649 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSUN3Q9H649 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSUN3Q9H649 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NSUN3Q9H649 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSUN3Q9H649 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms