Protein–RNA interactions for Protein: Q9H446

RWDD1, RWD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD1Q9H446 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RWDD1Q9H446 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RWDD1Q9H446 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms