Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms