Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIL1Q9H173 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms