Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY19

MS4A8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A8Q9BY19 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A8Q9BY19 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MS4A8Q9BY19 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MS4A8Q9BY19 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MS4A8Q9BY19 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MS4A8Q9BY19 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MS4A8Q9BY19 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MS4A8Q9BY19 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A8Q9BY19 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A8Q9BY19 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms