Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FNDC11Q9BVV2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNDC11Q9BVV2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms