Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM4

GGACT, Gamma-glutamylaminecyclotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGACTQ9BVM4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGACTQ9BVM4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms