Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTKNQ9BST9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms