Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms