Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms