Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP2Q99959 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms