Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms