Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY1Q96T51 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms