Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms