Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms