Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GPR78Q96P69 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPR78Q96P69 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPR78Q96P69 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPR78Q96P69 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GPR78Q96P69 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR78Q96P69 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms