Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms