Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC17Q96LX7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms