Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB6

LOXL4, Lysyl oxidase homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL4Q96JB6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LOXL4Q96JB6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LOXL4Q96JB6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXL4Q96JB6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXL4Q96JB6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXL4Q96JB6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXL4Q96JB6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXL4Q96JB6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXL4Q96JB6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXL4Q96JB6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXL4Q96JB6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXL4Q96JB6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXL4Q96JB6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXL4Q96JB6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXL4Q96JB6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXL4Q96JB6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXL4Q96JB6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXL4Q96JB6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LOXL4Q96JB6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LOXL4Q96JB6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LOXL4Q96JB6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LOXL4Q96JB6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LOXL4Q96JB6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LOXL4Q96JB6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LOXL4Q96JB6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms