Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGAP3Q96FM1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAP3Q96FM1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms