Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms