Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYTL4Q96C24 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms