Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms