Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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TRIM63Q969Q1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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TRIM63Q969Q1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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TRIM63Q969Q1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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TRIM63Q969Q1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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TRIM63Q969Q1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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