Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

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Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PTPRUQ92729 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
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PTPRUQ92729 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRUQ92729 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
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