Protein–RNA interactions for Protein: Q92560

BAP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAP1Q92560 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BAP1Q92560 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BAP1Q92560 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms