Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms