Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SH3RF2Q8TEC5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms