Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDM1Q8TC05 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.7 ms