Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
MYRIPQ8NFW9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms