Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms