Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms