Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND25

ZNRF1, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF1Q8ND25 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms