Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
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