Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SMIM20Q8N5G0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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