Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVH2

FOXP4, Forkhead box protein P4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP4Q8IVH2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXP4Q8IVH2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXP4Q8IVH2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXP4Q8IVH2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXP4Q8IVH2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXP4Q8IVH2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXP4Q8IVH2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXP4Q8IVH2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXP4Q8IVH2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FOXP4Q8IVH2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FOXP4Q8IVH2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXP4Q8IVH2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXP4Q8IVH2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXP4Q8IVH2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXP4Q8IVH2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXP4Q8IVH2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXP4Q8IVH2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXP4Q8IVH2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXP4Q8IVH2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXP4Q8IVH2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXP4Q8IVH2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXP4Q8IVH2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXP4Q8IVH2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXP4Q8IVH2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXP4Q8IVH2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXP4Q8IVH2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXP4Q8IVH2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXP4Q8IVH2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXP4Q8IVH2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXP4Q8IVH2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms