Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms