Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms