Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMC5Q6UXY8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms