Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms