Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO3Q6UWJ1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms