Protein–RNA interactions for Protein: Q6RI45

BRWD3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRWD3Q6RI45 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRWD3Q6RI45 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRWD3Q6RI45 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRWD3Q6RI45 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRWD3Q6RI45 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRWD3Q6RI45 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRWD3Q6RI45 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRWD3Q6RI45 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRWD3Q6RI45 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRWD3Q6RI45 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRWD3Q6RI45 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRWD3Q6RI45 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRWD3Q6RI45 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRWD3Q6RI45 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRWD3Q6RI45 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRWD3Q6RI45 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRWD3Q6RI45 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRWD3Q6RI45 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
BRWD3Q6RI45 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRWD3Q6RI45 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRWD3Q6RI45 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRWD3Q6RI45 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRWD3Q6RI45 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRWD3Q6RI45 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRWD3Q6RI45 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRWD3Q6RI45 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
BRWD3Q6RI45 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRWD3Q6RI45 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRWD3Q6RI45 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
BRWD3Q6RI45 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRWD3Q6RI45 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRWD3Q6RI45 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms