Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms