Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LARP1BQ659C4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms