Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms