Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms