Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNT2

TMEM201, Transmembrane protein 201, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201Q5SNT2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM201Q5SNT2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms