Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms